Pues...ese virus que supuestamente te "elimina las carpetas" y que cuando exploras tu memoria USB (o tu laptop...o tu computadora de escritorio), todas tus carpetas aparecen como accesos directos...y tu preocupación es grande, porque la información que allí tenés es IMPORTANTÍSIMA.
A continuación les detallo los pasos para poder reparar y sobre todo, recuperar la información.
Primero, deberás desinfectar tu memoria USB con cualquier antivirus (por supuesto...un antivirus actualizado).
Desinfectada la USB, accede a ella...y verás siempre, solo los accesos directos de las carpetas que ahi estaban. No es para asustarse ni mucho menos para darse por vencido; lo que ocurre es que las carpetas están ocultas. Procede a borrar todas las carpetas que sean acceso directo.
Luego, selecciona Organizar - Opciones de carpeta (si utilizas Windows 7...guíate por la figura).
En la pantalla emergente, selecciona la pestaña Ver y en la parte en donde dice Archivos y carpetas ocultos, marca la opción Mostrar archivos, carpetas y unidades ocultos.
Luego, en esa misma ventana, busca más abajo la opcion que dice Ocultar archivos protegidos del sistema operativo (recomendado) y desactívala.
Al darle aceptar...regresas a la ventana del explorador; ahi se verán ya las carpetas que no aparecian, pero ahora las verás como elementos ocultos (nota que se ven sombreadas).
Deberás dar clic derecho a cada carpeta...y dirigirte a PROPIEDADES, pestaña PERSONALIZAR...selecciona CAMBIAR ÍCONO.
Aparece la ventana Cambiar icono para la cerpeta XXXX (XXXX es el nombre de la carpeta). Observa que tiene un ícono que no reconoce el sistema; lo que tienes que hacer es seleccionar el ícono que aparece a la par (a la derecha)...y le das aceptar. A continuación, da clic en aceptar y aceptar en PROPIEDADES.
Ahhh...pero todavía la carpeta sigue oculta; vuelve a darle clic derecho a la carpeta y dirígete a PROPIEDADES. Desmarca (desactiva) la opción OCULTO, luego dale ACEPTAR.
Deberás repetir este procedimiento para cada una de las carpetas que tengas ocultas; creo que lleva un poco de tiempo pero, de esta manera recuperamos nuestras carpetas.
Si quieres probar con otras opciones...puedes consultar estas otras alternativas:
ELIMINAR VIRUS QUE CREAN ACCESOS DIRECTO
ELIMINAR VIRUS QUE CONVIERTEN CARPETAS EN ACCESOS DIRECTOS